第一股

戶籍登記、戶籍謄本、戶口名簿、門牌證明、印鑑登記與證明、國民身分證、更改姓名、原住民業務、跨機關通報、戶政法令、志工業務、自然人憑證、人別確認

第二股

編釘門牌、國籍行政、屋主申請逕遷、戶籍通報、人口統計、人口清查、協尋親人、親等關聯、機關及人民申請查詢、戶外宣導。

第三股

文書收發、印信、檔案、出納、生育補助、戶政規費及罰鍰、總務、財產及物品管理、學齡兒童、戶役政資訊系統及網站管理、研考。

卑南辦公室

戶籍登記、戶籍謄本、戶口名簿、門牌證明、印鑑登記與證明、國民身分證、更改姓名、原住民業務、跨機關通報、自然人憑證、人別確認
編釘門牌、國籍行政、屋主申請逕遷、戶籍通報、人口統計、協尋親人、親等關聯、機關及人民申請查詢、戶外宣導、協助辦理各項行政業務。

綠島辦公室

戶籍登記、戶籍謄本、戶口名簿、門牌證明、印鑑登記與證明、國民身分證、更改姓名、原住民業務、跨機關通報、自然人憑證、人別確認
編釘門牌、國籍行政、屋主申請逕遷、戶籍通報、人口統計、協尋親人、親等關聯、機關及人民申請查詢、戶外宣導、協助辦理各項行政業務。

蘭嶼辦公室

戶籍登記、戶籍謄本、戶口名簿、門牌證明、印鑑登記與證明、國民身分證、更改姓名、原住民業務、跨機關通報、自然人憑證、人別確認
編釘門牌、國籍行政、屋主申請逕遷、戶籍通報、人口統計、協尋親人、親等關聯、機關及人民申請查詢、戶外宣導、協助辦理各項行政業務。

會計室

辦理會計業務事項。

人事室

辦理人事管理事項。